Skip to main content

Table 1 Bias, variance (standard deviation), and RMS for different error estimators, with different base classification rules, for breast cancer gene expression data, and dimensionality .

From: Small-Sample Error Estimation for Bagged Classification Rules

Rule

stat

resb

boot

bresb

loo

b632

oob

sbresb

b632plus

cv5

lda

20

bias

0.0388

0.0287

0.0104

0.0063

0.0039

0.0076

0.0244

0.0092

0.0143

  

sd

0.0908

0.0944

0.0789

0.1004

0.0912

0.1003

0.0933

0.0938

0.1140

  

rms

0.0988

0.0986

0.0795

0.1006

0.0913

0.1006

0.0964

0.0942

0.1149

lda

40

bias

0.0198

0.0082

0.0084

0.0012

0.0021

0.0002

0.0168

0.0011

0.0044

  

sd

0.0657

0.0642

0.0614

0.0671

0.0638

0.0673

0.0676

0.0641

0.0714

  

rms

0.0686

0.0647

0.0620

0.0671

0.0639

0.0673

0.0696

0.0641

0.0716

lda

60

bias

0.0157

0.0000

0.0097

0.0045

0.0058

0.0036

0.0104

0.0054

0.0011

  

sd

0.0577

0.0559

0.0544

0.0580

0.0560

0.0581

0.0586

0.0560

0.0586

  

rms

0.0598

0.0559

0.0553

0.0582

0.0563

0.0582

0.0595

0.0563

0.0587

cart

20

bias

0.1554

0.0456

0.0330

0.0226

0.0284

0.0267

0.0225

0.0096

0.0094

  

sd

0.0653

0.1047

0.0671

0.1210

0.0798

0.1229

0.0700

0.1059

0.1187

  

rms

0.1686

0.1142

0.0747

0.1231

0.0847

0.1258

0.0735

0.1063

0.1190

cart

40

bias

0.1583

0.0323

0.0358

0.0095

0.0378

0.0143

0.0284

0.0094

0.0058

  

sd

0.0484

0.0697

0.0502

0.0774

0.0533

0.0799

0.0516

0.0671

0.0810

  

rms

0.1655

0.0769

0.0616

0.0780

0.0653

0.0812

0.0589

0.0677

0.0812

cart

60

bias

0.1722

0.0211

0.0377

0.0001

0.0501

0.0043

0.0317

0.0232

0.0050

  

sd

0.0400

0.0624

0.0473

0.0705

0.0473

0.0701

0.0472

0.0590

0.0695

  

rms

0.1768

0.0658

0.0605

0.0705

0.0689

0.0703

0.0569

0.0634

0.0697

3nn

20

bias

0.0964

0.0575

0.0478

0.0270

0.0009

0.0269

0.0176

0.0273

0.0076

  

sd

0.0716

0.0996

0.0649

0.1174

0.0835

0.1167

0.0778

0.1005

0.1156

  

rms

0.1201

0.1150

0.0806

0.1204

0.0835

0.1197

0.0798

0.1041

0.1159

3nn

40

bias

0.0952

0.0406

0.0481

0.0109

0.0094

0.0139

0.0214

0.0075

0.0036

  

sd

0.0529

0.0687

0.0493

0.0787

0.0590

0.0785

0.0577

0.0669

0.0801

  

rms

0.1089

0.0798

0.0689

0.0794

0.0598

0.0797

0.0615

0.0673

0.0802

3nn

60

bias

0.0962

0.0316

0.0504

0.0034

0.0154

0.0054

0.0261

0.0012

0.0008

  

sd

0.0432

0.0625

0.0452

0.0693

0.0526

0.0693

0.0514

0.0595

0.0680

  

rms

0.1054

0.0701

0.0677

0.0694

0.0548

0.0695

0.0576

0.0595

0.0680