Skip to main content

Table 2 Bias, variance (standard deviation), and RMS for different error estimators, with different base classification rules, for lung cancer gene expression data, and dimensionality .

From: Small-Sample Error Estimation for Bagged Classification Rules

Rule

stat

resb

boot

bresb

loo

b632

oob

sbresb

b632plus

cv5

lda

20

bias

0.0243

0.0238

0.0070

0.0075

0.0061

0.0103

0.0294

0.0094

0.0106

  

sd

0.0938

0.0938

0.0827

0.0989

0.0923

0.0988

0.0910

0.0932

0.1025

  

rms

0.0969

0.0967

0.0830

0.0992

0.0925

0.0993

0.0956

0.0937

0.1031

lda

40

bias

0.0118

0.0109

0.0012

0.0017

0.0025

0.0044

0.0273

0.0033

0.0045

  

sd

0.0675

0.0655

0.0628

0.0684

0.0656

0.0685

0.0652

0.0656

0.0694

  

rms

0.0685

0.0664

0.0628

0.0684

0.0657

0.0686

0.0707

0.0657

0.0695

lda

60

bias

0.0092

0.0067

0.0023

0.0004

0.0009

0.0015

0.0235

0.0012

0.0020

  

sd

0.0606

0.0587

0.0570

0.0608

0.0590

0.0608

0.0586

0.0590

0.0610

  

rms

0.0613

0.0591

0.0570

0.0608

0.0591

0.0609

0.0632

0.0590

0.0610

cart

20

bias

0.0945

0.0321

0.0025

0.0100

0.0145

0.0139

0.0076

0.0031

0.0017

  

sd

0.0502

0.0852

0.0623

0.0916

0.0683

0.0945

0.0676

0.0811

0.0849

  

rms

0.1069

0.0911

0.0623

0.0921

0.0699

0.0955

0.0681

0.0812

0.0849

cart

40

bias

0.0926

0.0226

0.0230

0.0071

0.0198

0.0088

0.0141

0.0071

0.0022

  

sd

0.0384

0.0630

0.0439

0.0694

0.0504

0.0705

0.0472

0.0577

0.0654

  

rms

0.1003

0.0670

0.0496

0.0698

0.0542

0.0710

0.0493

0.0581

0.0655

cart

60

bias

0.0938

0.0202

0.0277

0.0043

0.0218

0.0068

0.0210

0.0103

0.0012

  

sd

0.0335

0.0544

0.0397

0.0590

0.0438

0.0597

0.0414

0.0496

0.0571

  

rms

0.0996

0.0580

0.0484

0.0592

0.0490

0.0601

0.0464

0.0507

0.0571

3nn

20

bias

0.0483

0.0474

0.0185

0.0114

0.0122

0.0132

0.0027

0.0238

0.0040

  

sd

0.0552

0.0803

0.0529

0.0876

0.0677

0.0870

0.0623

0.0765

0.0787

  

rms

0.0734

0.0932

0.0561

0.0884

0.0688

0.0880

0.0624

0.0802

0.0788

3nn

40

bias

0.0489

0.0236

0.0270

0.0043

0.0031

0.0055

0.0094

0.0027

0.0004

  

sd

0.0435

0.0602

0.0411

0.0626

0.0519

0.0624

0.0484

0.0555

0.0593

  

rms

0.0655

0.0646

0.0492

0.0627

0.0520

0.0626

0.0493

0.0555

0.0593

3nn

60

bias

0.0500

0.0198

0.0317

0.0031

0.0059

0.0036

0.0147

0.0009

0.0028

  

sd

0.0381

0.0526

0.0383

0.0555

0.0459

0.0553

0.0439

0.0486

0.0514

  

rms

0.0629

0.0562

0.0497

0.0556

0.0462

0.0555

0.0463

0.0486

0.0514